Tento web používá soubory cookie. Dalším používáním webu s tímto souhlasíte.
jméno
heslo
přihlásit
zaregistrujte se
zapomněli jste heslo?
Organická syntéza
BORAG
Tento klub slouží k procvičování schopnosti navrhovat jednoduché i pokročilé mnohakrokové organické syntézy. Navrhovatel řešené struktury (tj. jedinec, který úspěšně vyřešil předchozí syntézu) by měl volit látku, se kterou již dříve pracoval, aby byl schopný rozsoudit správné řešení, v případě, že se jich objeví více.

Prosím respektujte následující pravidla:
1. Při navrhování syntéz používejte jako reagenty pouze komerčně dostupné látky.
2. Syntéza by neměla mít více než deset kroků.
3. Navržený sled reakcí vkládejte ve formě obrázků! Slovní popis n-stupňové syntézy nebude nejspíš nikdo číst.
4. Doba na vyřešení struktury je předběžně stanovena na JEDEN TÝDEN - pokud se do té doby nepříjde s vhodným řešením, je navrhovatel povinen zveřejnit správné znění. Dalším navrhovatelem se pak stává osoba, která se k tomuto řešení nejvíce přiblížila.
5. Navrhovatel se může své funkce dobrovolně vzdát ve prospěch jiného diskutujícího.
6. Navržena může být i struktura, kterou plánujete připravit a rádi byste postup zkonzultovali, popř. zjistili i jiné úhly pohledu.
7. Jakékoliv příspěvky mimo téma diskuze budou nemilosrdně mazány.

Přeji příjemnou zábavu!
Máte k tomu co říct? Vložte se do diskuze.
MRTY --- 19:39:49 22.6.2018
KOCOURMIKES: divim se, ze na predikci MNR spekter jeste nikdo nezkusil nasadit machine learning. by prece muselo fungovat. ale mozna je to jen muj amatersky pohled na vec...
KOCOURMIKES --- 18:00:10 22.6.2018
CHEMIK: NMR neslo donedavna pocitat prakticky vubec tak, aby to mohlo byt uzitecne pro porovnavani a reseni spekter, od roku 2017 je to dost dobre mozne s [GFN-xTB]//PBEh-3c[DCOSMO-RS] :]
BORAG: muzu spocitat nebo napsat autorovi, zda to zvladne metoda - dik za tip. bylo pocitano na 20-30 let stare metode zeano, kde nerozlisilo singlet vs. multiplet.
KOCOURMIKES --- 16:19:48 22.6.2018
abych upresnil, tahle nova metoda treba na 500-1000 atomu - v pohode a velmi rychle spocita NMR - priklad molekuly typu modifikovany taxol nebo kofaktor vitamin B12 - a takove porovnavaci spektrum se muze velmi hodit /da se to interaktivne porovnavat oznacene atomy ve vypoctu s vypocitanym a namerenym spektrem, a tak dolustit + clovek vi kde tam metoda ma svoje meze/, treba pri NMR identifikaci neznamych a slozitych prirodnich latek. spis teda pro NMR specialisty co u toho sedi. 500 atomu je spocitane asi za hodinu dve, tisice atomu trochu dele. je to - semiempiricky tight-binding s korekcemi + cosmo-rs.
KOCOURMIKES --- 15:56:54 22.6.2018
lepsi priklad: Strychnin - tohle je vyrazny pokrok, ale joo

[GFN-xTB]//PBEh-3c[DCOSMO-RS] - metoda 2017


/ pred 10-15 let notoricky neslo pocitat NMR vubec, GIAO atd. co bylo v Gaussianu atd. BYLO o nicem, tohle uz ma prakticky vyznam

nevim co je za posledni metody v DALTONu, coz je spektroskopicky vypocetni kod, ktery pouzivaji organicti syntetici na prakticke orientacni porovnavaci vypocty spekter - hlavne teda UV, NMR tam zrejme neni vubec

2017 NMR clanek je tady

Fully Automated Quantum-Chemistry-Based Computation of Spin-Spin-Coupled Nuclear Magnetic Resonance Spectra. - PubMed - NCBI
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28906074

[//i.nyx.cz/files/00/00/18/62/1862244_407e43e5fff4f2606494.png?name=obrazek.png]
BORAG --- 11:18:51 22.6.2018
CHEMIK: to chápu a soucítím :-)
CHEMIK --- 11:15:45 22.6.2018
BORAG: No, mne staci me triterpeny :)
BORAG --- 11:04:52 22.6.2018
CHEMIK: no a to buď rád, že nepracuješ s malými cykly jako bicyklo[1.1.1]pentany nebo bicyklo[2.2.2]oktany, tam už výpočty nesedí ale vůbec (ty první jsou experimentálně singlety, zatímco výpočet ukazuje komplexní multiplety...)
CHEMIK --- 10:46:52 22.6.2018
KOCOURMIKES: Hm, na to jak je to mala molekula a relativne jednoducha, tak zatim (alespon pro me) k hovnu :)
KOCOURMIKES --- 10:29:31 22.6.2018
solidni pokrok ve vypoctech NMR spekter (check po 10 letech vyvoje)





[//i.nyx.cz/files/00/00/18/62/1862142_be2f08940eb1a162c70a.png?name=image.png]